Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CSRNP3Q8WYN3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
CSRNP3Q8WYN3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms