Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk4Q8VEJ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk4Q8VEJ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk4Q8VEJ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.5 ms