Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam20bQ8VCS3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam20bQ8VCS3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms