Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCOLN3Q8TDD5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCOLN3Q8TDD5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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