Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00612Q8N6U2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms