Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8N3U1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8N3U1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8N3U1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8N3U1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8N3U1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8N3U1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N3U1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N3U1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N3U1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N3U1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N3U1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N3U1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N3U1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms