Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT78Q8N1N4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT78Q8N1N4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT78Q8N1N4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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