Protein–RNA interactions for Protein: Q8K561

Otoa, Otoancorin, mousemouse

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtoaQ8K561 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OtoaQ8K561 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OtoaQ8K561 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OtoaQ8K561 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OtoaQ8K561 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OtoaQ8K561 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OtoaQ8K561 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OtoaQ8K561 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OtoaQ8K561 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OtoaQ8K561 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OtoaQ8K561 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms