Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brd3Q8K2F0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms