Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd3Q8K2C9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hacd3Q8K2C9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms