Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Polr1eQ8K202 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1eQ8K202 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms