Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HACE1Q8IYU2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACE1Q8IYU2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms