Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPA2Q8IWL1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPA2Q8IWL1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms