Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC83Q8IWF9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC83Q8IWF9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms