Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Card11Q8CIS0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Card11Q8CIS0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Card11Q8CIS0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms