Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SltmQ8CH25 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SltmQ8CH25 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms