Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ClasrpQ8CFC7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ClasrpQ8CFC7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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