Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam228aQ8CDW1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam228aQ8CDW1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms