Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E4f1Q8CCE9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4f1Q8CCE9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms