Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp1Q8C8U0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms