Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Alx1Q8C8B0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alx1Q8C8B0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Alx1Q8C8B0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Alx1Q8C8B0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Alx1Q8C8B0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Alx1Q8C8B0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Alx1Q8C8B0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Alx1Q8C8B0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms