Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cwc22Q8C5N3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cwc22Q8C5N3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms