Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek11Q8C0Q4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek11Q8C0Q4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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