Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Catsper4Q8BVN3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Catsper4Q8BVN3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Catsper4Q8BVN3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms