Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl3Q8BVF2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl3Q8BVF2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms