Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms