Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC11Q7Z392 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms