Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDXQ7Z353 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDXQ7Z353 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDXQ7Z353 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDXQ7Z353 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDXQ7Z353 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDXQ7Z353 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDXQ7Z353 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDXQ7Z353 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms