Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ62

Podn, Podocan, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PodnQ7TQ62 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PodnQ7TQ62 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PodnQ7TQ62 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PodnQ7TQ62 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PodnQ7TQ62 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PodnQ7TQ62 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PodnQ7TQ62 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PodnQ7TQ62 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PodnQ7TQ62 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PodnQ7TQ62 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PodnQ7TQ62 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PodnQ7TQ62 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PodnQ7TQ62 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms