Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Robo2Q7TPD3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Robo2Q7TPD3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Robo2Q7TPD3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo2Q7TPD3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo2Q7TPD3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo2Q7TPD3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo2Q7TPD3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo2Q7TPD3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo2Q7TPD3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms