Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmc8Q7TN58 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmc8Q7TN58 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmc8Q7TN58 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmc8Q7TN58 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmc8Q7TN58 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmc8Q7TN58 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmc8Q7TN58 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmc8Q7TN58 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmc8Q7TN58 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmc8Q7TN58 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmc8Q7TN58 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms