Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HhipQ7TN16 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms