Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms