Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd3eapQ76KJ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms