Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC9Q6ZRR7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC9Q6ZRR7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms