Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC36A4Q6YBV0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms