Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp8b3Q6UQ17 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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