Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ptx4Q6RUU0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptx4Q6RUU0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptx4Q6RUU0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptx4Q6RUU0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptx4Q6RUU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptx4Q6RUU0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms