Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms