Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Neil2Q6R2P8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms