Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms