Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A9

Arl11, ADP-ribosylation factor-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl11Q6P3A9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl11Q6P3A9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl11Q6P3A9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms