Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asic1Q6NXK8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms