Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOBEC3HQ6NTF7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms