Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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