Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lcn12Q6JVL5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms