Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rftn1Q6A0D4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms