Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms