Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a1Q60714 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms