Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm1Q60636 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms