Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc125Q5U465 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms